Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDSRQ06136 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDSRQ06136 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms