Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	PIR3	YKL163W	978 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	URA4	YLR420W	1095 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SHE1	YBL031W	1017 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YNL234W	YNL234W	1281 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	MED7	YOL135C	669 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	VPS53	YJL029C	2469 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YCL068C	YCL068C	783 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YEL074W	YEL074W	339 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	FMP32	YFL046W	624 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SOL4	YGR248W	768 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	BNA1	YJR025C	534 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	OAR1	YKL055C	837 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SIW14	YNL032W	846 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	POS5	YPL188W	1245 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	HFD1	YMR110C	1599 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	MSN4	YKL062W	1893 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	GAT2	YMR136W	1683 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	POL31	YJR006W	1464 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YDL241W	YDL241W	372 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	PRE9	YGR135W	777 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	ISA1	YLL027W	753 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	PRX1	YBL064C	786 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YOL024W	YOL024W	519 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YGL214W	YGL214W	486 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YHL045W	YHL045W	348 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YJL028W	YJL028W	336 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	RPL22A	YLR061W	366 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	TOM7	YNL070W	183 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YBR255C-A	YBR255C-A	363 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SPS2	YDR522C	1509 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YML020W	YML020W	1995 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	TRS85	YDR108W	2097 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SPB4	YFL002C	1821 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SMP3	YOR149C	1551 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	MTH1	YDR277C	1302 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	UBP6	YFR010W	1500 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YLR345W	YLR345W	1530 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	DIN7	YDR263C	1293 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SEM1	YDR363W-A	270 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	HRT3	YLR097C	1035 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	RIB4	YOL143C	510 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	TMA16	YOR252W	537 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YAR1	YPL239W	603 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	UPC2	YDR213W	2742 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	URC2	YDR520C	2319 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	ACE2	YLR131C	2313 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	NOG1	YPL093W	1944 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	snR63	snR63	255 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YDR391C	YDR391C	699 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	FOL2	YGR267C	732 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	FMC1	YIL098C	468 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	HTA2	YBL003C	399 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	BLS1	YLR408C	369 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	RAD10	YML095C	633 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YGK3	YOL128C	1128 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SIP1	YDR422C	2448 nt		4.46	□□□□□ -1.69
SYF1	Q04048	SEN1	YLR430W	6696 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RPP1A	YDL081C	321 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	CLC1	YGR167W	702 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	CIR1	YGR207C	786 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	BET1	YIL004C	429 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	COQ5	YML110C	924 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	CUZ1	YNL155W	825 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	CTR86	YCR054C	1692 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	VPS30	YPL120W	1674 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	TDA3	YHR009C	1572 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	TPA1	YER049W	1935 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	VAC17	YCL063W	1272 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	ARC15	YIL062C	465 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	GPI12	YMR281W	915 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	YBL059W	YBL059W	582 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RMD5	YDR255C	1266 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	MRPS35	YGR165W	1038 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	COS8	YHL048W	1146 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	NRK1	YNL129W	723 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	IDI1	YPL117C	867 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	POP4	YBR257W	840 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	SLM5	YCR024C	1479 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	TOG1	YER184C	2385 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	PTA1	YAL043C	2358 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RPA14	YDR156W	414 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	YDR222W	YDR222W	1248 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	ATP12	YJL180C	978 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	SWC7	YLR385C	399 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	PFA4	YOL003C	1137 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	YCL022C	YCL022C	516 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	RSF2	YJR127C	4143 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	ERG5	YMR015C	1617 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	FAA1	YOR317W	2103 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	YDL026W	YDL026W	312 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	YGL132W	YGL132W	336 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SYF1	Q04048	MCK1	YNL307C	1128 nt		4.42	□□□□□ -1.7

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