Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID5AQ03989 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID5AQ03989 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID5AQ03989 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms