Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSG1Q02413 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG1Q02413 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms