Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB1Q01826 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB1Q01826 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms