Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DEFA6Q01524 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms