Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SCN7AQ01118 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN7AQ01118 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCN7AQ01118 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN7AQ01118 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN7AQ01118 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN7AQ01118 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN7AQ01118 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN7AQ01118 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN7AQ01118 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN7AQ01118 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN7AQ01118 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCN7AQ01118 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN7AQ01118 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCN7AQ01118 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCN7AQ01118 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN7AQ01118 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN7AQ01118 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms