Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM2Q00987 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM2Q00987 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms