Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF9Q00978 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms