Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFKB2Q00653 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFKB2Q00653 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms