Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC42EP1Q00587 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP1Q00587 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms