Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2BQ00403 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2BQ00403 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2BQ00403 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms