Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VLDLRP98155 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VLDLRP98155 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms