Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX1P83916 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX1P83916 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX1P83916 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX1P83916 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX1P83916 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX1P83916 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX1P83916 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX1P83916 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms