Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP5P82980 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP5P82980 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP5P82980 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP5P82980 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP5P82980 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP5P82980 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP5P82980 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP5P82980 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP5P82980 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP5P82980 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP5P82980 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP5P82980 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP5P82980 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP5P82980 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP5P82980 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP5P82980 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms