Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX6P78412 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX6P78412 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX6P78412 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX6P78412 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX6P78412 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IRX6P78412 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IRX6P78412 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IRX6P78412 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IRX6P78412 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IRX6P78412 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX6P78412 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX6P78412 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX6P78412 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX6P78412 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX6P78412 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX6P78412 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX6P78412 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX6P78412 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX6P78412 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX6P78412 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX6P78412 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
IRX6P78412 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX6P78412 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX6P78412 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms