Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITX1P78337 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITX1P78337 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITX1P78337 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITX1P78337 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX1P78337 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX1P78337 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX1P78337 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX1P78337 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITX1P78337 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITX1P78337 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITX1P78337 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITX1P78337 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PITX1P78337 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PITX1P78337 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PITX1P78337 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX1P78337 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX1P78337 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX1P78337 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PITX1P78337 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms