Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2LP62875 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2LP62875 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2LP62875 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms