Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPD3P62318 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms