Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms