Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFC1P60507 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVFC1P60507 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms