Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00315P59091 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00315P59091 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms