Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RHBDL3P58872 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms