Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX16P57768 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX16P57768 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX16P57768 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNX16P57768 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX16P57768 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX16P57768 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX16P57768 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX16P57768 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX16P57768 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms