Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX10P56693 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX10P56693 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX10P56693 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX10P56693 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX10P56693 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX10P56693 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX10P56693 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX10P56693 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX10P56693 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX10P56693 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX10P56693 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX10P56693 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX10P56693 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX10P56693 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX10P56693 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX10P56693 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX10P56693 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX10P56693 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX10P56693 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX10P56693 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX10P56693 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX10P56693 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms