Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1P56182 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1P56182 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1P56182 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1P56182 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1P56182 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1P56182 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1P56182 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1P56182 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRP1P56182 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRP1P56182 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRP1P56182 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRP1P56182 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1P56182 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1P56182 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1P56182 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1P56182 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1P56182 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1P56182 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1P56182 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1P56182 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1P56182 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1P56182 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1P56182 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1P56182 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1P56182 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1P56182 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms