Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFRA1P56159 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms