Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3BP55884 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms