Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP7P55210 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASP7P55210 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASP7P55210 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP7P55210 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP7P55210 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP7P55210 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP7P55210 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP7P55210 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP7P55210 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP7P55210 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP7P55210 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP7P55210 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP7P55210 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP7P55210 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASP7P55210 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASP7P55210 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms