Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HADHBP55084 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HADHBP55084 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HADHBP55084 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HADHBP55084 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HADHBP55084 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HADHBP55084 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HADHBP55084 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HADHBP55084 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HADHBP55084 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HADHBP55084 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHBP55084 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHBP55084 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHBP55084 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHBP55084 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms