Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIF1P55008 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIF1P55008 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIF1P55008 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AIF1P55008 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIF1P55008 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIF1P55008 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIF1P55008 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIF1P55008 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIF1P55008 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIF1P55008 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIF1P55008 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms