Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GYS2P54840 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GYS2P54840 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GYS2P54840 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GYS2P54840 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GYS2P54840 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GYS2P54840 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GYS2P54840 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GYS2P54840 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GYS2P54840 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GYS2P54840 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GYS2P54840 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GYS2P54840 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GYS2P54840 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GYS2P54840 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GYS2P54840 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GYS2P54840 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GYS2P54840 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GYS2P54840 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms