Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB3P54753 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms