Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMTNP53814 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMTNP53814 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMTNP53814 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMTNP53814 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMTNP53814 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMTNP53814 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMTNP53814 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMTNP53814 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMTNP53814 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMTNP53814 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMTNP53814 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMTNP53814 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMTNP53814 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMTNP53814 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMTNP53814 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMTNP53814 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMTNP53814 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMTNP53814 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNP53814 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNP53814 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNP53814 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNP53814 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNP53814 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNP53814 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNP53814 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMTNP53814 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMTNP53814 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMTNP53814 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMTNP53814 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMTNP53814 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNP53814 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNP53814 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNP53814 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms