Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PGGT1BP53609 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGGT1BP53609 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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PGGT1BP53609 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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