Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNHP51946 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNHP51946 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNHP51946 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNHP51946 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNHP51946 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNHP51946 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNHP51946 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNHP51946 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNHP51946 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNHP51946 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms