Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC3P51654 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC3P51654 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC3P51654 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC3P51654 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC3P51654 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC3P51654 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC3P51654 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC3P51654 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC3P51654 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC3P51654 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC3P51654 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC3P51654 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms