Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA4P51532 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
SMARCA4P51532 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA4P51532 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms