Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBP50607 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBP50607 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBP50607 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBP50607 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBP50607 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBP50607 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBP50607 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBP50607 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms