Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETV1P50549 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETV1P50549 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETV1P50549 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETV1P50549 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETV1P50549 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETV1P50549 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ETV1P50549 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ETV1P50549 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms