Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNTAP49354 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNTAP49354 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNTAP49354 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTAP49354 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTAP49354 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNTAP49354 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTAP49354 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTAP49354 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTAP49354 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTAP49354 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTAP49354 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNTAP49354 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNTAP49354 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNTAP49354 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNTAP49354 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNTAP49354 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNTAP49354 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms