Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms