Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD2P49005 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD2P49005 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD2P49005 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD2P49005 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLD2P49005 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms