Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMTP48728 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMTP48728 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMTP48728 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMTP48728 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMTP48728 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms