Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP1P48552 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP1P48552 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms