Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA1P46926 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms