Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACADSBP45954 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACADSBP45954 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms