Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSR1P43307 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR1P43307 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR1P43307 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR1P43307 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR1P43307 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR1P43307 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms