Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSOP43234 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSOP43234 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSOP43234 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSOP43234 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTSOP43234 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTSOP43234 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSOP43234 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSOP43234 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSOP43234 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSOP43234 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSOP43234 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSOP43234 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSOP43234 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSOP43234 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSOP43234 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSOP43234 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSOP43234 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms