Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTGER3P43115 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms